實時熒光定量PCR技術(Real Time Quantitative PCR)
在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程,zui后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。
相對定量應用(Relative Quantification,RQ)
特異性熒光標記:
TaqMan法
TaqMan探針的特性:
(1)5′端標記有報告基團(Reporter, R),如FAM、VIC等
(2)3′端標記有熒光淬滅基團 (Quencher, Q)
(3)探針完整,R所發射的熒光能量被Q基團吸收 ,無熒光, R與Q分開,發熒光
(4)Taq酶有 5′→3′外切核酸酶活性,可水解探針
相對定量通過內標定量:
內標(Endogenous Control)通常是β-actin、GAPDH基因等看家基因,在細胞中的表達量或在基因組中的拷貝數恒定,受環境因素影響小,內標定量結果代表了樣本中所含細胞或基因組數量。
相對定量分析方法 :
2-ΔΔCt
前提:目標序列和內參序列的擴增效率接近100%且偏差在5%以內
1、用內參基因的CT值歸一目標基因的CT值:
ΔCT(test)= CT(target,test)-CT(ref,test)
ΔCT(calibrator)= CT(target,calibrator)-CT(ref, calibrator)
2、用校準樣本的ΔCT值歸一試驗樣本的ΔCT值:
ΔΔCT= ΔCT(test) - ΔCT(calibrator)
3、計算表達水平比率:
2 –ΔΔCT=表達量的比值
服務流程:
步驟 | 客 戶 提 供 | 服 務 內 容 | 基 屹 提 供 |
1 | 新鮮的且盡量多的材料;已知的全長基因序列;盡可能詳細的背景資料:DNA/ RNA來源、豐度等。 | DNA/RNA提取,根據基因序列設計特異性的引物和熒光探針。 | |
2 | 純化好的DNA/RNA(大于5 ug/樣品);已知的全長基因序列;盡可能詳細的背景資料:DNA/ RNA來源、豐度等。 | 根據基因序列設計特異性的引物和熒光探針。 | |
3 | 以DNA為模板,對目的基因進行熒光定量PCR檢測分析 | 提供完整的定量分析結果、實驗熒光定量擴增曲線及詳細的實驗步驟。 |
注意:客戶可根據所能提供的起始材料不同,選擇從步驟1或2啟動項目。